La administración de los colegios de la Fundación Astoreca depende directamente del Directorio de cada uno de los establecimientos. Éstos se reúnen todas las semanas en el colegio, con la directora y subdirectoras docente y administrativa. Cada Directorio asume la responsabilidad absoluta del colegio.
Todas las actividades del colegio se realizan en torno a proyectos y el Consejo directivo de la fundación mantiene el seguimiento exhaustivo de éstos.
La Dirección del colegio trabaja en conjunto con el equipo docente, con el fin de estar al tanto de la realidad de lo que ocurre en la sala de clases. El trabajo semanal del profesorado con la Dirección coopera positivamente con el control de la realización de las actividades propias del año académico.